杏山、塔山两处明将不降，四月九日，济尔哈朗以红衣大炮炮轰塔山，歼灭明军七千。二十二日，又炮轰杏山，豁口长达25丈，明军投降。松锦之战结束。
失去松锦，明朝就失去了辽东到关内的战略要地。清军进入中原只是时间和机会的问题了。
入关之战
顺治元年四月二十二日清朝睿亲王多尔衮指挥清兵以以逸待劳的战术在山海关战胜李自成，清朝从此开始进军中原统一全国，由割据政权变为全国性的政权，而山海关之战便是清朝历史上关键性的一战。
这一仗需从吴三桂说起。
吴三桂字长白，江苏高邮人，父亲叫吴襄，住北京。吴三桂是崇祯时总兵，守宁远。顺治元年三月，当李自成自太原而宁武、大同，向北京进军之时，崇祯帝封他为平西伯，入卫京都。吴三桂向北京进发，在滦州（河北滦县）遭遇李自成派来攻滦州的两位降将——唐通、白广恩，之后又退回山海关。李自成叫吴襄给吴三桂写了一封劝降信，加上4万两犒银，由唐通送给吴三桂。吴三桂见大势已去，决定投降。
山海关由李自成派来的2万人驻守。当吴三桂走到滦州时，听到爱妾陈圆圆被李自成的大将刘宗敏掠去，大怒，立刻改变投降主意。返回山海关，赶走李自成守关将士。四月十五日，吴三桂写信给多尔衮乞降并乞师，共同攻打李自成。二十日多尔衮再次得到吴三桂催师函，二十一日多尔衮率师到离关10里处。
得知吴三桂变卦消息后，李自成于二十一日率兵数万（一说20万，又一说6万），到山海关，以吴襄为人质。并派唐通出兵一片石（在山海关北）堵截吴三桂。又派兵政部尚书王则尧再去招降吴三桂。清军击败唐通，王则尧为吴三桂扣留。吴三桂迎接多尔衮，剃髮，表示效死清廷。多尔衮令吴三桂为先锋，以白布系肩，作记号，以便第二天大战时辨认。
第二天大战。农民军队伍从北山排到海边。吴三桂依多尔衮命令，衝击李自成的前锋。李自成在西山观战。农民军张两翼围吴军数匝，双方相斗数十回合，呼声震海。战至中午，颳起大风，灰尘漫天。就在农民军疲敝的此时，清将阿济格、多铎率铁骑衝击农民军中坚。清军入关，农民军原来不知道。李自成见了，吃惊地说：“这是满洲兵！”便策马下岗。农民军见李自成下岗，军心涣散，便溃散了。
多尔衮令吴三桂追赶，至永平，李自成再败。吴三桂将王则尧交给多尔衮，多尔衮杀王则尧，封吴三桂为平西王。
李自成在向北京撤退路上杀吴襄。至京，杀了吴三桂全家。四月二十九日，李自成在北京即皇帝位。次日西撤。
20年抗清烈火 20年血腥镇压
清廷入关，引发了剧烈的民族矛盾，长城内外，大江南北，都燃起了抗清烈火，此起彼伏，长达20多年。抗清力量可分为三支：农民起义军、残明政权和汉族官僚知识分子。清政府利用抗清力量本身的矛盾，采取各个击破的方针，经过20多年的漫长岁月，依靠八旗、绿营，采取剿抚并举的策略终于把三支力量都镇压了下去，实现了全国的统一。
农民起义军的抗清及清王朝的镇压
当李自成的农民起义军蓬勃发展，明王朝就要被他们取而代之时，多尔衮曾派人以福临的名义给农民军送信，表示“协谋同心，并取中原”，欲分一杯羹。后来范文程献计，改与农民军共同争夺明朝天下为与农民军争夺天下，便把农民军视为统一中原的最大障碍而作为重点打击对象。早在吴三桂“乞师”之时，多尔衮就恶狠狠地说：“与流贼不共戴天。”多尔衮率军进关，进攻农民起义军，打的是“为明讨贼”的旗号，以引诱明朝官僚地主的支持。他们在山海关击败李自成后，一直穷追不舍。农民起义军斗志顽强，大部在抗清失败后，余部仍坚持了10多年。
李自成山海关失败后，于顺治元年四月三十日离开北京，南走河北，然后西走山西。多尔衮即令英王阿济格、多铎、吴三桂紧追不舍。顺治元年五月，李自成在河北望都、定州反击清军失败。五月四日到真定，当日与第二日李自成与吴三桂大战，被射中胁下，负伤而走。然后，李自成率兵经井陉（ｘíｎɡ），过固关，入山西。十二日，清军到了固关就停止追击，返回北京。
李岩建议到河南发展，李自成听信牛金星谗言把他杀害，离散了军心和人心。九月十五日，随李自成西撤的唐通降清，引清军进攻李自成家乡米脂县。
顺治元年七月上旬李自成回到西安，确定以关中为根据地，打算“先恢剿宁武、代州、大同、宣府等处，后赴北京、山海，剿除辽左”。他派兵守陕北，进攻晋北，出潼关，下河南，招降了大同明总兵姜瓖。
十月十九日多尔衮令阿济格攻打李自成，吴三桂、尚可喜跟随出征。二十五日又派多铎带领孔有德、耿仲明先讨伐李自成，然后征服南明政权。顺治二年正月，费英东子图赖率兵攻打潼关，李自成败绩。当时阿济格与吴三桂已到西安之北，李自成放弃西安，潼关、西安相继陷于清军之手。李自成从蓝田经武关（陕西丹凤东南）入湖北襄阳，在九宫山为地主杀害。
李自成死后，余部坚持抗清。郝摇旗、刘体纯率10多万人与明将何腾蛟联合，李自成妻高夫人与高一功、李过率30万人与明将堵胤锡联合。联军在岳州城下、藤溪、湘阴大胜清平南大