增田失踪的时候，给了“shika”root的权限。他担心作为root的自己失踪后，因为没有管理人，会给极地研造成麻烦，就设定市之濑的登录名“shika”有管理权。
由于自己的疏忽和丹羽的暴行，让增田变得神经衰弱，继而失踪，整个事件极度折磨着市之濑的神经。一天天过去了，她越来越确信增田已经自杀，对丹羽也越来越憎恨了。她很恨丹羽，但丹羽却一直像没事人一样。市之濑的自尊让她维持了表面的平静。这种状况持续了一年以上。市之濑从那以后，就再也不喝酒了。
丹羽健二郎和服部珠子的婚约，最早是告诉木熊教授的。那是事件发生前一个月。市之濑无论如何也无法原谅丹羽，而且，当她从教授那里听到他们的婚约时，她确信服部珠子也知道了这件事。按丹羽的性格，不说是不可能的。对市之濑的自尊来说，两年前与丹羽的那段纠葛，是绝不想让别人知道的。她希望那件事情就一直冻结着。
然而，事件在第二年时解冻了。
丹羽健二郎接收了增田留下的文件和磁碟。一个偶然的机会，他发现增田的磁碟里有一个叫“shika”的文件，看起来像是情书。这时，丹羽才渐渐明白了市之濑和增田的关係，也知道了增田失踪是因为自己与市之濑在联欢会那晚的事情。但是，丹羽并没有反省自己的责任，反而想利用这件事情来威胁市之濑。一方面，市之濑肯定不会对别人说那件事，另一方面，失踪的增田和市之濑的恋爱关係，也是一个爆炸性新闻。丹羽想敲诈点钱，而且他的博士论文必须在一年内完成，他想让市之濑帮他的忙。
丹羽的提议，或者说是胁迫，让市之濑很震惊。她当即就下了杀丹羽的决心。既然服部珠子知道真相，那也得一起杀了。就这样，市之濑开始思考如何杀死两个研究生。
另一方面，正如犀川所指出的，木熊教授是市之濑的生父。虽然户籍上并非如此，但市之濑里佳从母亲那里听到过许多父亲的事情。里佳的母亲，是不可能说木熊坏话的。在少女里佳的心目中，还未见过面的父亲是理想中的男性形象。这也引导着她在贫困的生活中努力学习。她长大后，和父亲一样立志于钻研学问，进入了父亲所在的N大学工学部。她进入大学的时候，木熊就知道了。父女在十八年后重逢，他们悄悄地度过了许多属于父女两人的时光。这之后的十年，是非常幸福的十年。
市之濑作为木熊的继承者，发挥了无可挑剔的才华。他们两个有共同的语言，是最默契的搭檔。市之濑年纪轻轻就获得了好几个论文奖，木熊也在这十年取得了惊人的研究成果。但和增田的恋爱，市之濑没有对父亲说。市之濑和木熊的父女关係，纯粹是学术领域的互相尊敬，父女间的感情，是非常纯粹的。
但是，市之濑两年前的不幸遭遇，让他们陷入了疯狂。一直痛苦着的市之濑，决心把自己无处发泄的愤怒和所面对的状况，全部都告诉木熊。这也是出于对丹羽健二郎和服部珠子若无其事地拜託木熊当主婚人的愤恨。丹羽健二郎对木熊的讨好，是市之濑怎么也无法忍受的。这超越了她理性的界限。她把所有的事情都告诉了自己的生父。
从女儿那里听到这些，木熊被激怒了。对女儿的感情，马上就升华为对丹羽的杀意。从那以后，木熊和市之濑每天晚上都演习着杀死丹羽健二郎和服部珠子的计划。两位学者，为了杀死自己的学生，充分运转着那优秀的大脑。如果卷门没有故障的话，可能他们的计划就完全成功了。
市之濑里佳对自己杀人的事实供认不讳，但关于木熊教授的自杀，她什么也没说。如果市之濑是出于自己的意愿移动了木熊教授的尸体的话，在量刑上会严厉得多。但是关于这一点，她一直不置可否。
“想像得出来吗？在这种状况下……木熊教授和市之濑的配合……”犀川在电话里对西之园本部长说，“不知道该说些什么了……太悲壮了……看上去好像是冷静的判断，但当时两个人一定都已经疯狂了。真是让人毛骨悚然的情境啊！”
“是啊。我们这些常人都有点理解不了啊。”西之园本部长也同意道，“木熊京介和市之濑里佳都是自尊心极强的人。大学老师可能都是如此吧！”
“嗯，差不多吧……”犀川边说边想着，自己可能也是这样吧。
“自尊心是最重要的东西啊！”本部长说道。
“的确如此。人惟一拥有的就是自尊了。”犀川也同样道。
“什么？是吗？……这不是普通的爱情、亲情，分明感觉到还有别的力量在里面……”本部长沉痛地说,“这种力量是对伤害了作为学者的纯粹性的愤怒吧……”
“大概吧。”犀川含糊地答道。他并非不明白西之园本部长的话，但那是一种他自己从未体验过的感情。“但学问本来就是靠不住的。”
确实，本来这就不是来自外部的伤害。
“是吗？你也这么想吗？”西之园本部长问道，“年纪轻轻的……”
“不是。”犀川否定道，“知道学问是不可靠的，这才是学问的开始。在考试中取得满分的时候，才知道学问是靠不住的……这正是学问的开始。”