目标应当是四周环绕着工人宿舍的兵工厂；使用原子弹前无须警告日本政府。”此外，委员会还打算把“小炸弹”用于计划在7月中旬开展的核试爆，而“大炸弹（枪式构型）”则会用于“对日本的首次打击”。委员会提出，采取任何其他策略都会令“促使日本迅速投降这一主要目标”面临风险。包括奥本海默在内，这群杰出的核物理学家也都赞同该观点，并在报告中写道：“我们无法提出任何有可能结束战争的技术论证；除了直接在军事上应用，我们没有其他任何替代选项。”
鉴于过渡委员会的职能“完全是咨询性的”，所以最终负责向杜鲁门总统建议的人还得是战争部长史汀生。史汀生的结论虽然是“独立思考”的结果，但与委员会的结论“十分相似”。在史汀生看来，“迫使（日本）天皇及其军事顾问真正投降”的唯一途径就是实施“沉重的打击”，把美国“有能力摧毁日本帝国的确凿证据摆到他们面前”。他认为，这种“有效的打击虽然会造成一定的伤亡，却能挽救美日双方数倍于此的生命”。
事实上，把委员会的建议告知杜鲁门总统的人并不是史汀生。同日晚些时候，吉米·伯恩斯在白宫与杜鲁门临时会晤，向总统汇报委员会的讨论结果。杜鲁门震惊不已。没过多久，杜鲁门就向总统公关顾问伦纳德·赖因施(Leonard Reinsch)透露了他的担忧：“伦纳德，我刚得到一些重要信息。我必须做出一个史无前例的决定。当然，我会做出决定，但这件事光是想一想就令人恐惧。”
他不止一次地对伦纳德补充说：“我真希望能和你谈谈此事。”当然，杜鲁门不能将此事告诉他。6
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